本馆现有藏品23675件，其中大多来自原中央工艺美术学院旧藏。1999年清华大学艺术博物馆项目启动以来，源源不断地接收了来自艺术家、收藏家、校友等社会贤达捐赠的优秀艺术品，藏品规模不断扩充、规格不断提升、品类不断丰富，主要涉及绘画、雕塑、书法、染织、陶瓷、家具、青铜器及综合艺术品等多个门类。
染织类藏品的时代涵盖明清及近现代，包括织锦、漳绒、妆花、缂丝等工艺种类；书画类藏品兼具今古，不乏文征明、祝允明、吕纪、蓝瑛、陈洪绶、董其昌、王翚、王原祁、王铎、傅山、华喦、郑板桥、罗聘、任伯年、吴昌硕、齐白石、徐悲鸿、吴冠中等名家巨迹；家具类藏品时代自明至近现代，主要有桌案、椅凳和柜架类，也有少量床围和箱类家具；陶瓷类藏品种类丰富，从新石器时期直至现当代，包括红陶、灰陶、彩陶、黑陶、原始瓷、青瓷以及色彩缤纷的颜色釉瓷、彩绘瓷以及当代国际陶艺作品等；青铜类藏品以铜镜为主，主体为校友王纲怀先生所捐赠的汉镜及和镜；综合艺术类藏品主要为现当代竹、木、牙、角等质地艺术品，其中不乏日本、朝鲜、柬埔寨、苏联时期的贵重国礼；此外尚有邮票、剪纸、文书类藏品。
